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Biostatistiques appliquées à la génomique et aux neurosciences , Apprentissage automatique , Expectiles et quantiles , Outils de prédiction

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418 545-5011 poste 2596

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amadoudiogo.barry@inrs.ca

Bureau principal
Unité mixte de recherche INRS-UQAC en santé durable
555, boulevard de l’Université
Chicoutimi (Québec) G7H 2B1
Canada

 

Centre Armand-Frappier Santé Biotechnologie

531, boulevard des Prairies
Laval (Québec)  H7V 1B7
Canada

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Intérêts de recherche

Les activités de recherche du professeur Amadou Barry portent sur l’intégration des expectiles et des quantiles dans la modélisation statistique et dans le développement des méthodes d’apprentissage machine pour une meilleure modélisation des données génomiques et d’imagerie cérébrale. Ses travaux s’articulent autour des thèmes de recherche suivants en lien avec les données génomiques et d’imagerie cérébrale :

  • Booster l’inférence statistique avec les expectiles et les quantiles pour une meilleure inférence
  • Appliquer les expectiles et les quantiles aux méthodes d’apprentissage machine
  • Adapter les expectiles et les quantiles aux méthodes en haute dimension
  • Développer des méthodes statistiques en lien avec les données généalogiques de BALSAC
  • Développer des outils statistiques et d’apprentissage machine pour réduire le bruit dans les données, en particulier les données volumineuses

Le professeur Amadou Barry est statisticien et possède une formation en mathématiques. Il est détenteur d’un master en mathématiques pures de l’Université de Leiden (Pays-Bas, 2007) et d’un master en mathématiques appliquées aux sciences sociales de l’Université de Provence (France, 2010).

Après cinq années à l’Institut national de santé publique du Québec comme statisticien (2010-2015), il a fait un doctorat en statistique à l’Université du Québec à Montréal (2019). Par la suite, en 2021-2022, le professeur Barry a effectué un stage postdoctoral au département d’épidémiologie et de biostatistique de l’Université McGill, puis à l’Université du Québec à Chicoutimi avec le groupe de Catherine Laprise. Il s’est joint au corps professoral du Centre Armand-Frappier Santé Biotechnologie de l’INRS en mai 2022. Son laboratoire est situé à l’UQAC au sein de l’Unité mixte de recherche INRS-UQAC en santé durable.

Publications

PUBLICATIONS

Kaartinen, M. T., Hang A., Barry A., Arora M., Heinonen S., Lundbom J., Hakkarainen A., et al. (2022). “Matrisome alterations in obesity – Adipose tissue transcriptome study on monozygotic weight-discordant twins”. Matrix Biology Journal. https://doi.org/10.1016/j.matbio.2022.02.005.

Barry, A., Oualkacha, K., and Charpentier, A. (2021), “A new GEE method to account for heteroscedasticity using asymmetric least-square regressions,” Journal of Applied Statistics, 1–27. https://doi.org/10.1080/02664763.2021.1957789.

Guma E., Bordignon P. D. C., Devenyi G. A., Gallino D., Anastassiadis C., Cvetkovska V., Barry A., et al. (2021). “Early or Late Gestational Exposure to Maternal Immune Activation Alters Neurodevelopmental Trajectories in Mice: An Integrated Neuroimaging, Behavioural, and Transcriptional Study.” Biological Psychiatry. https://doi.org/10.1016/j.biopsych.2021.03.017.

Bhagwat N., Barry A., Dickie E. W., Brown S. T., Devenyi G. A., Hatano K., DuPre E., et al. (2021). “Understanding the Impact of Preprocessing Pipelines on Neuroimaging Cortical Surface Analyses.” GigaScience 10, no. giaa155. https://doi.org/10.1093/gigascience/giaa155.

Bazinet A., Rys R. N., Barry A., Greenwood C. M. T., Young Y. K., Mendoza A., LaPorta I., Wever C. M., Mercier F. E., and Johnson N. A. (2021). “A 10-Color Flow Cytometry Panel for Diagnosis and Minimal Residual Disease in Chronic Lymphocytic Leukemia.” Leukemia & Lymphoma 0, no. 0: 1–8. https://doi.org/10.1080/10428194.2021.1919658.

Kaartinen, M. T., Arora M., Heinonen S., Hang A., Barry A., Lundbom J., Hakkarainen A., et al. (2020). “F13A1 Transglutaminase Expression in Human Adipose Tissue Increases in Acquired Excess Weight and Associates with Inflammatory Status of Adipocytes.” International Journal of Obesity, 1–11. https://doi.org/10.1038/s41366-020-00722-0.

Barry A., Bhagwat N., Misic B., Poline J. B., and Greenwood C. M. T. (2020). “Asymmetric Influence Measure for High Dimensional Regression.” Communications in Statistics – Theory and Methods, 1–27. https://doi.org/10.1080/03610926.2020.1841793.

Auger N., Lemieux L., Bilodeau-Bertrand M., Barry A., and Costopoulos A. (2018). “Quantile Regression Analysis of Language and Interpregnancy Interval in Quebec, Canada.” Health Promotion and Chronic Disease Prevention in Canada : Research, Policy and Practice 38, no. 5: 200–209. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5990335/.

Blouin C., Hamel D., Vandal N., Barry A., Lo E., Lacroix G., Laguë L., et al. (2016). “The Economic Consequences of Obesity and Overweight among Adults in Quebec.” Canadian Journal of Public Health = Revue Canadienne de Santé Publique 107, no. 6: e507–13. https://doi.org/10.17269/CJPH.107.5585.

Papineau E., Lemétayer L., Barry A., and Biron J. F. (2015). “Lottery Marketing in Québec and Social Deprivation: Excessive Exposure, Insufficient Protection?” International Gambling Studies 15, no. 1: 88–107. https://doi.org/10.1080/14459795.2014.1000355.

Charpentier A. and Barry A. (2015). “Passer d’une analyse de corrélation à une interprétation causale.Risques 101: 107–111.

O’Loughlin J. L., Barry A., O’Loughlin E. K., and Tremblay M. (2014). “Home Smoking Bans May Increase the Risk of Smoking Onset in Children When Both Parents Smoke.” Nicotine & Tobacco Research 16, no. 7: 1009–13. https://doi.org/10.1093/ntr/ntu035.

Auger N., Feuillet P., Martel S., Lo E., Barry A., and Harper S. (2014). “Mortality Inequality in Populations with Equal Life Expectancy: Arriaga’s Decomposition Method in SAS, Stata, and Excel.” Annals of Epidemiology 24, no. 8: 575-580.e1. https://doi.org/10.1016/j.annepidem.2014.05.006.

Trempe N., Boivin M. C., Lo E., and Barry A. (2014). “L’utilisation de la variable sur la langue d’usage à la maison du Registre des décès du Québec.” Cahiers québécois de démographie 43, no. 1: 163–80. https://doi.org/10.7202/1025494ar.

O’Loughlin E. K., Tremblay M., Dugas E. N., Barry A., and O’Loughlin J. L. (2013). “Effect of Anti-Smoking Legislation on School Staff Smoking May Dissipate over Time.” European Journal of Public Health 23, no. 5: 791–93. https://doi.org/10.1093/eurpub/ckt009.

Auger N., Harper S., and Barry A. (2013). “Diverging Socioeconomic Inequality in Life Expectancy of Francophones and Anglophones in Montréal, Québec: Tobacco to Blame?” Journal of Public Health 21, no. 4: 317–24. https://doi.org/10.1007/s10389-013-0559-6.

Burrows S., Auger N., Tamambang L., and Barry A. (2013). “Suicide Mortality Gap between Francophones and Anglophones of Quebec, Canada.” Social Psychiatry and Psychiatric Epidemiology 48, no. 7: 1125–32. https://doi.org/10.1007/s00127-012-0637-z.

Auger N., Harper S., Barry A., Trempe N., and Daniel M. (2012). “Life Expectancy Gap between the Francophone Majority and Anglophone Minority of a Canadian Population.” European Journal of Epidemiology 27, no. 1: 27–38. https://doi.org/10.1007/s10654-011-9644-8.

Barry A., and Louboutin S. R. (2009). “On the Fourth Moment of Theta Functions at Their Central Point.” In Contemporary Mathematics, edited by Gilles Lachaud, Christophe Ritzenthaler, and Michael A. Tsfasman, 487:1–7. Providence, Rhode Island: American Mathematical Society. https://doi.org/10.1090/conm/487/09521.

 

ARTICLES DE REVUE

Barry A., Oualkacha K., and Charpentier A. (2021). “Weighted asymmetric least squares regression with fixed-effects.” arXiv:2108.04737 [econ]. http://arxiv.org/abs/2108.04737. Submitted to: The Econometrics Journal.

Barry A., Bhagwat N., Misic B., Poline J. B., and Greenwood C. M. T. (2021). “An algorithm-based multiple detection influence measure for high dimensional regression using expectiles.” https://doi.org/10.48550/arXiv.2105.12286 Submitted to: Annals of Statistics Journal.

 

RAPPORTS ET AUTRES DOCUMENTS

Barry A. (2019). “La régression expectile pour l’analyse des données longitudinales.Université du Québec à Montréal.

Blouin C., Vandal N., Barry A., Jen Y., Hammel D., Lo E., and Martel S. (2016). “Les conséquences économiques associées à l’obésité et à l’embonpoint au Québec: les coûts liés à l’hospitalisation et aux consultations médicales.” Institut National de Santé Publique du Québec. http://collections.banq.qc.ca/ark:/52327/2890928.

Tremblay M., Barry A., and O’Loughlin E. K. (2014). “L’effet de l’interdiction de fumer sur les terrains des écoles pourrait se dissiper avec le temps.” Institut National de Santé Publique du Québec.

Trempe, N., Boivin M. C., Lo E., and Barry A. (2012). “La validité de la variable « Langue d’usage à la maison » du Fichier des décès du Québec : synthèse.Institut National de Santé Publique du Québec.

Trempe N., Barry A., Lussier M. H., and Lo E. (2011). “La connaissance et l’utilisation de la langue anglaise par les professionnels de la santé et des services sociaux au Québec.” Montréal, Québec: Institut national de santé publique du Québec. http://www.deslibris.ca/ID/229929.

Barry, Amadou. (2007). “The Abc Conjecture and K-Free Numbers.” Leiden University.

 

CONFÉRENCES ET ALLOCUTIONS INVITÉES

Lizotte M, Barry A and Greenwood CMT (2021). A Machine Learning Method for Outlier Detection. LDI Virtual Undergraduate Research Day 2021, August.

Barry A, Bhagwat N, Misic B, Poline JB, and Greenwood CMT (2021). Asymmetric High Dimensional Influence Measure. Congrès annuel de la Société statistique du Canada.

Barry A, Bhagwat N, Misic B, Poline JB, and Greenwood CMT (2021). Identifying outliers in high dimension: application to neuroimaging data. Lady Davis Research Institute and Centre for Clinical Epidemiology 2021 Seminar Series, McGill.

Barry A, Bhagwat N, Misic B, Poline JB, and Greenwood CMT (2021). Identifying outliers in high dimension: application to neuroimaging data. University of North Carolina at Greensboro, North Carolina USA.

Hang A, Barry A, Arora M, Pietiläinen KH, Kaartinen MT (2020). Matrisome alterations in adipose tissue in obesity – A transcriptome study on monozygotic weight-discordant twins. Annual McGill Biomedical Graduate Conference, Montreal, October.

Arora M, Hang A, Barry A, Pietiläinen KH, Kaartinen MT (2020). F13A1 transglutaminase in human adipose tissue associated with weight gain, and inflammatory status of adipocytes. Annual McGill Biomedical Graduate Conference, Montreal, October.

Barry A, Oualkacha K, and Charpentier A (2019). Penalized Weighted Asymmetric Least Squares Regression for Longitudinal Data with Fixed-effects. Congrès annuel de la Société statistique du Canada, University of Calgary, Calgary.

Barry A, Oualkacha K, and Charpentier A (2018). Expectile Regression for Longitudinal Data. Congrès annuel de la Société statistique du Canada, McGill University, Montréal.

Barry A, Oualkacha K, and Charpentier A (2017). Quantile and Expectile Regression for Random Effects Models. Congrès annuel de la Société statistique du Canada, University of Manitoba, Winnipeg.

Barry A and Charpentier A (2017). La régression quantile et expectile appliquées au Modèle avec effets aléatoires. 10e Colloque Jeunes Chercheurs du Centre interuniversitaire québécois de statistiques sociales, Université de Sherbrooke, Sherbrooke.

Barry A and Charpentier A (2014). La régression quantile : une analyse complète de la relation entre les variables aléatoires stochastiques, pourquoi la privilégier et quand? 82e congrès de l’ACFAS, Université Concordia, Montréal.

Barry A, Lussier MH, Lo E and Trempe N (2014). La mortalité évitable des groupes linguistiques du Québec. 79e congrès de l’ACFAS, Bishops University, Sherbrooke.