Laboratoire de bio-optique et biogéochimie aquatique

Le Laboratoire de bio-optique et biogéochimie aquatique permet d’effectuer des recherches sur les effets des changements climatiques et du dégel du pergélisol sur la dynamique de mélange et la transparence de l’eau en milieu lacustre, et leurs multiples conséquences sur le réseau alimentaire microbien, les émissions de gaz à effet de serre et l’habitat oxythermique.

Sonde à fluorescence sur une bouée sur le lac St-Charles, terrain de (Sarah Goubet doctorante dans l'équipe d'Isabelle Laurion et Karem Chokmani)

Les recherches effectuées au Laboratoire de bio-optique et biogéochimie aquatique portent également sur le développement d’outils optiques pour la détection précoce des fleurs d’eau d’algues et de cyanobactéries et autres problématiques liées au brunissement des eaux. 

Le Laboratoire de bio-optique et biogéochimie aquatique comprend les équipements suivants :

  • Cytomètre en flux (FACSCalibur, BD) permettant d’analyser les propriétés optiques     et physiologiques des organismes microbiens (ex. ADN, pigments, abondance);
  • Fluoroprobe (BBE Moldaenke) permettant de faire des profils verticaux des assemblages planctoniques in situ dans les milieux aquatiques (ex. migration verticale du phytoplancton, localisation rapide des cyanobactéries);
  • Microscope inverse à épifluorescence (Axiovert, Zeiss) permettant d’identifier et de caractériser les espèces planctoniques (ex. fluorescence naturelle du phytoplancton et marqueurs d’ADN);
  • Fluorimètre PAM (Phyto-PAM, Walz) permettant de déterminer les caractéristiques physiologiques des organismes photosynthétiques (ex. rendement quantique, photo-inhibition);
  • Photomètre (MicroPro, Satlantic) permettant de faire des profils verticaux d’éclairement à 8 longueurs d’onde dans le visible et les UV (ex. cœfficients d’extinction);
  • Profileurs physicochimiques (YSI EXO2 et ProODO) permettant de faire des profils verticaux de la température, de l’oxygène dissous, de la conductivité, de la turbidité, de la fluorescence par le phytoplancton, et de la fluorescence par la matière organique dissoute;
  • Système de mesure en continu des gaz dissous dans l’eau (prototype pour CO2, CH4 et O2) permettant d’estimer l’émission de gaz à effet de serre par les systèmes aquatiques;
  • Système de mesure du CO2 dans l’air (EGM-4, PP-Systems) permettant de mesurer les flux de CO2 à l’interface eau-air des lacs et des mares.
  • Système de mesure de l’oxygène dissous par fibre optique (FiBox 4, PreSens) permettant de mesurer le taux de consommation de l’oxygène (respiration bactérienne).

Le Laboratoire de biooptique et biogéochimie aquatique est à la disposition du corps professoral, de la clientèle étudiante et du personnel du Centre Eau Terre Environnement de l’INRS pour leurs projets de recherche. 

Il est également possible d’utiliser les ressources du laboratoire, et notre expertise, dans le cadre de collaborations externes ou de contrats de recherche et développement. 

Contactez-nous pour en savoir plus.

Les équipements du laboratoire de biooptique et biogéochimie aquatique appuient les travaux de l’équipe de la professeure Isabelle Laurion. Ils permettent entre autres :

  • de caractériser et dénombrer les petites particules (bactéries, picophytoplancton; cytométrie en flux);
  • de faire le suivi des microorganismes possédant une fluorescence naturelle (cyanobactéries, chlorophytes, diatomées ou dinoflagellés, cryptophytes; fluoroprobe);
  • de décrire leur morphométrie et leur taxonomie (microscopie inverse par épifluorescence);
  • d’étudier leur physiologie (fluorimétrie PAM);
  • d’évaluer l’empreinte de carbone d’un écosystème aquatique;
  • de faire une diagnose limnologique des plans d’eau affectés par les activités anthropiques.

Il serait éventuellement possible de combiner à ces instruments (microscope et cytomètre) l’utilisation de sondes moléculaires fluorescentes afin d’améliorer la taxonomie des procaryotes ou d’étudier certains aspects physiologiques.

Personnes-ressources

Isabelle Laurion
Professeure et responsable scientifique
Courriel : isabelle.laurion@ete.inrs.ca
Téléphone : 418 654-2694

Stéfane Prémont
Responsable du laboratoire
Téléphone : 418 654-2537
Courriel : stefane.premont@ete.inrs.ca

Laboratoire de bio-optique et biogéochimie aquatique

Institut national de la recherche scientifique 

Centre Eau Terre Environnement 

490, rue de la Couronne

Québec (Québec)  G1K 9A9

CANADA

Voir sur la carte