Frédéric Veyrier

Expertises

Bactériologie génomique et évolution

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frederic.veyrier@iaf.inrs.ca

Centre Armand-Frappier Santé Biotechnologie

531, boulevard des Prairies
Laval  (Québec)  H7V 1B7
CANADA

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Intérêts de recherche

  • Évolution des symbiotes bactériens
    • Neisseria meningitidis et autres pathogènes du nasopharynx
    • Mycobacterium tuberculosis
    • Helicobacter pylori
  • Écologie microbienne du nasopharynx :
    Mécanismes d’interaction bactéries-bactéries
  • Étude des modifications de la paroi bactérienne lors de l’adaptation à un nouvel écosystème

Projets de recherche en cours

Il y a au moins dix fois plus de bactéries que de cellules humaines dans l’organisme. Celles-ci se répartissent dans différents écosystèmes, notamment au niveau des systèmes digestif, respiratoire et de la peau. Ces bactéries ont co-évolué avec l’homme et jouent maintenant un rôle primordial dans la survie de l’organisme. Pour qu’elles soient tolérées, certains mécanismes ont dû être mis en place pour discriminer les microorganismes agressants des microorganismes bénéfiques pour la santé. Ces interactions bactérie-hôte sont encore incomprises, mais celles-ci passeraient notamment par la détection de certaines composantes bactériennes au niveau du système immunitaire.

L’équipe du laboratoire du professeur Frédéric Veyrier tente d’élucider les mécanismes expliquant cette tolérance en étudiant des événements évolutifs qui ont mené ces bactéries à s’adapter à leurs écosystèmes. Plus spécifiquement, le professeur Veyrier et son équipe concentrent leurs recherches sur le rhinopharynx, la porte d’entrée du système respiratoire. Récemment, les recherches ont permis de démontrer que certaines espèces bactériennes ont subi une modification profonde de la structure de leur peptidoglycane, un polymère essentiel et exclusif à la paroi bactérienne. Cette molécule est reconnue par le système immunitaire et sert donc à détecter la présence de bactéries dans l’organisme. Le professeur Veyrier et son équipe étudient l’implication de ces changements dans la communication bactéries-hôte et la présence de certains motifs dans le peptidoglycane qui expliquerait leur tolérance.

À l’inverse, ils tentent de comprendre comment certaines bactéries symbiotes obligatoires peuvent aussi évoluer en pathogènes pouvant causer des maladies aux issues fatales en se concentrant, par exemple, sur Neisseria meningitidis et Mycobacterium tuberculosis causant respectivement la méningite et la tuberculose.

Finalement, le professeur Veyrier et son équipe tentent aussi de déterminer si la flore bactérienne tolérée du rhinopharynx peut inhiber ou promouvoir la présence de certains pathogènes comme Neisseria meningitidis et les mécanismes moléculaires sous-jacents. Ces connaissances seront indispensables au développement de nouvelles stratégies pour combattre les pathogènes, principalement à l’heure où les résistances aux antibiotiques se généralisent.

Publications

Original research articles

•    Taha MK, Veyrier FJ, Claus H, Lappann M,  Otto A, Becher D, Deghmane AE, Frosch M, Hellenbrand W, Hong E, Parent du Châtelet I, Prior K, Harmsen D, Vogel U. Evolutionary Events Associated with an Outbreak of Meningococcal Disease in Men Who Have Sex with Men. PLoS One (IF: 3.23), 2016 May 11;11(5):e0154047.

 

•    Veyrier FJ*, Biais N, Morales P., Belkacem N, Guilhen C, Ranjeva S, Sismeiro O, Péhau-Arnaudet G, Rocha EP, Werts C, Taha MK, Boneca IG*. Common cell shape evolution of two nasopharyngeal pathogens. PLoS Genetics(IF: 8.17), 2015 Jul 10;11(7):e1005338.

 

•    Wang J, McIntosh F, Radomski N, Dewar K, SimeoneR, Enninga J, BroschR, RochaEP, VeyrierFJ* & Behr MA*. Insights on the emergence of Mycobacterium tuberculosisfrom the analysis of Mycobacterium kansasii. Genome Biology and Evolution. (IF : 4.53) 2015 Feb 25;7(3):856-70.

 

•    Ratet G, Veyrier FJ, Fanton d’Andon M, Kammerscheit X, Nicola MA, Picardeau M, Werts C*. Live imaging of bioluminescent Leptospira interrogans in mice reveals renal colonization as a stealth escape from the immune response and antibiotics. PLoS Negl Trop Dis. 2014 Dec 4;8(12):e3359. doi: 10.1371/journal.pntd.0003359.

 

•    Williams AH, Veyrier FJ, Bonis M, Michaud Y, Raynal B, Taha MK, Haouz A & Boneca IG*. Visualization of a substrate-induced catalytic triad of the Neisseria meningitidis peptidoglycan O-acetylesterase reveals mechanistic conservation in the SGNH esterase family member. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2014, Oct;70(Pt 10):2631-9. doi: 10.1107/S1399004714016770.

 

•    Radomski N, Roguet A, Lucas FS, Veyrier FJ, Cambau E, Accrombessi H, Moilleron R, Behr MA & Moulin L*. atpE gene as a new useful specific molecular target to quantify Mycobacterium in environmental samples.  BMC microbiology, 2013, Dec 3;13:277.

 

•    Veyrier FJ,  Ecobichon C, Boneca IG*. Draft Genome Sequence of Helicobacter pylori X47-2AL. Genome announc, 2013, Dec 19;1(6). pii: e01095-13.

 

•    Veyrier FJ*, Hong E, Deghmane AE, Taha MK*. Draft Genome Sequence of a Neisseria meningitidis Serogroup C Isolate of Sequence Type 11 Linked to an Outbreak among Men Who Have Sex with Men. Genome announc, 2013, Oct 3;1(5). pii: e00795-13.

 

•    Hansen JM, Golchin SA, Veyrier FJ, Domenech P, Boneca IG, Azad AK, Rajaram MVS, Schlesinger LS, Divangahi M, Reed MB & Behr MA*. N-glycolylated peptidoglycan contributes to the immunogenicity but not pathogenicity of Mycobacterium tuberculosis. J Infect Dis, 2013, Dec 19. [Epub ahead of print]

 

•    Veyrier FJ*, Williams A, Mesnage S, Schmitt C, Taha MK & Boneca IG*. De-O-acetylation of peptidoglycan regulates glycan chain extension and affects in vivo survival of Neisseria meningitidis. Mol Microbiol, 2013, Mar;87(5):1100-12.

 

•    Hong E, Hedberg ST, Abad R, Fazio C, Enríquez R, Deghmane AE, Jolley KA, Stefanelli P, Unemo M, Vazquez J, Veyrier FJ & Taha MK*. Target gene (gyrA, parC and parE) sequencing to define the susceptibility of Neisseria meningitidis to ciprofloxacin. Antimicrob Agents Chemother, 2013, Apr;57(4):1961-4.

 

•    Veyrier FJ*, Boneca IG, Cellier MF & Taha MK. Manganese export, via a new family of metallo-transporters, is positively selected to regulate the Mn/Fe intracellular ratio in N. meningitidis. PLOS Pathog, 2011, 7:e1002261

 

•    Veyrier F, Pletzer D, Turenne C & Behr MA*. Phylogenetic detection of horizontal gene transfer during the step-wise genesis of Mycobacterium tuberculosis. BMC Evol Biol, 2009, 9:196

 

•    Coulombe F, Divangahi M, Veyrier FJ, de Léséleuc L, Gleason J, Yang Y, Kelliher MA, Pandey AK, Sassetti CM, Reed MB & Behr MA*. Increased NOD2-mediated recognition of N-glycolyl muramyl dipetide. J Exp Med, 2009, 206:1709-16

 

•    Divangahi M, Coulombe F, Mostowy S, Kosak R, Veyrier F, Guillot L, Reed MB, Gleason J, Kobayashi KS, Flavell RA, Gros P & Behr MA*. NOD2-deficient mice have impaired resistance to Mycobacterium tuberculosis infection through defective innate and adaptive immunity. J Immunol, 2008, 181:7157-65

 

•    Veyrier F, Said-Salim B & Berh MA*. Evolution of the mycobacterial SigK regulon. J Bacteriol, 2008, 190:1891-9

 

•    Chaloupka R, Courville P, Veyrier F, Knudsen B, Tompkins TA & Cellier MF*. Identification of essential amino acids in the Nramp family by a combination of evolutionary analysis and biophysical studies of metal and proton co-transport in vivo. Biochemistry, 2005, 44:726-33

 

•    Courville P, Chaloupka R, Veyrier F & Cellier MF*. Determination of transmembrane topology of the Escherichia coli natural resistance-associated macrophage protein (Nramp) ortholog. J Biol Chem, 2004, 279:3318-26

 

 

Reviews

•    Chen NH, Djoko KY, Veyrier FJ, McEwan AG. Formaldehyde Stress Responses in Bacterial Pathogens. Front Microbiol. 2016 Mar 3;7:257.

 

•    Veyrier FJ* & Cellier MF*. Metal economy in host-microbe interactions. Front Cell Infect Microbiol, 2015, 4:190, 10.3389/fcimb.2014.00190. eCollection 2014.

 

•    Guilhen C, Taha MK & Veyrier FJ*. Role of transition metal exporters in virulence: the example of Neisseria meningitidis. Front Cell Infect Microbiol, 2013, 10.3389/fcimb.2013.00102

 

•    Veyrier FJ, Dufort A & Behr MA*. The rise and fall of the Mycobacterium tuberculosis genome. Trends Microbiol, 2011, 19:156-61

 

 

Book chapters

•    Wheeler R, Veyrier FJ, Werts C, Boneca IG*. Peptidoglycan and Nod receptors.  Glycoscience: Biology and Medicine, Springer