Doctorat en biologie

3805

Philosophiæ doctor, Ph. D.

90

Avec thèse

Ce programme est offert conjointement avec l’Université du Québec à Montréal (UQAM).

Ce programme d’études est offert à temps complet.

Aux fins d’inscription, le montant des droits et frais de scolarité à payer varie selon le pays d’origine et le programme. En savoir plus

L’étudiante ou l’étudiant est admissible au programme de bourses en sciences de la santé et en sciences pures et appliquées de l’INRS ainsi qu’à différents programmes de bourses pour financer ses études.

Automne 30 mars
Hiver 1er novembre
Été 1^er mars

Pour les programmes de doctorat, les dates d’admission sont flexibles. Toute demande d’admission reçue après ces dates pourra donc être analysée.

Voir le calendrier universitaire

L’admission à ce programme d’études est conditionnelle à l’acceptation d’une professeure ou d’un professeur de diriger vos travaux de recherche.

En savoir plus sur les étapes d’une demande d’admission

Les cours sont offerts en français.

Des cours de langues sont offerts aux étudiantes et étudiants non-francophones.

Si vous avez obtenu un diplôme dans un pays autre que le Canada ou dans une province canadienne hors Québec, vérifiez les équivalences des diplômes avant de faire une demande d’admission à un programme d’études.

Jacques Bernier

Description officielle du programme de doctorat en biologie (PDF)

Bureau du registraire

Téléphone : 418 654-2518
Sans frais au Québec : 1 877 326-5762

Courriel : registrariat@inrs.ca

Cet atelier d’une durée de trois jours est destiné à initier les candidat(e)s à la gestion du personnel et de budgets.

Le séminaire permet à l’étudiant(e) de présenter devant public les résultats de son travail de recherche. Pour ce faire, l’étudiante ou l’étudiant utilise les méthodes de préparation et de présentation d’un exposé sur les résultats de recherche en sciences biologiques. Une attention particulière est apportée à la préparation et à l’utilisation des illustrations ainsi qu’à la prestation. La présentation de ce séminaire devra être faite durant le 9e trimestre après l’inscription initiale de l’étudiant(e).

Les principes théoriques de l’apprentissage, de la planification de cours et des pédagogies actives comme l’exposé interactif et l’apprentissage par problèmes sont abordés. Le cours traite aussi brièvement de soutien à l’apprentissage et s’appuie sur les recherches effectuées dans le domaine de la pédagogie.

Cette activité permet de définir et de limiter de façon concrète et opérationnelle son projet de thèse. Le projet de thèse doit être conforme aux objectifs du programme et se situer dans le cadre des champs de spécialisation du programme. Il doit comporter un énoncé de la problématique, des objectifs, des hypothèses de travail, des méthodes, des résultats attendus, de l’échéancier et du budget si nécessaire. Le projet de thèse est présenté par écrit sous forme de demande de subvention, puis débattu en public durant un séminaire. Il devra être complété durant le premier trimestre ou au plus tard au deuxième trimestre après l’inscription initiale de l’étudiant(e).

L’examen de synthèse a pour but d’évaluer la capacité de synthèse de la candidate ou du candidat et de s’assurer qu’elle ou qu’il connaît bien la problématique et le contenu scientifique des recherches effectuées dans sa discipline, mais aussi dans le pôle de recherche où il évolue. Dans le cadre de cette activité, la candidate ou le candidat approfondit un thème qui ne fait pas directement partie de son sujet de thèse, mais qui peut lui être complémentaire. L’examen de synthèse donne lieu à un rapport écrit qui sera soutenu devant jury au plus tard à la fin du quatrième trimestre.

Chaque étudiante ou étudiant est tenu de rédiger une thèse qui démontre son aptitude à mener à bien une recherche scientifique originale et à la débattre devant un jury.

Élaboration de modèles d’explication des phénomènes biologiques. Définition d’hypothèses de travail. Techniques de sondage et plans d’expérience en biologie. Choix de tests statistiques et d’estimateurs. Analyses de variance et de covariance. Régression et corrélation. Méthodes de groupement. Analyses en espace réduit. Analyses de séries chronologiques. Ce cours comprend des travaux pratiques impliquant l’utilisation du logiciel SAS.

Remarque : La matière enseignée dans ce cours présume une connaissance des notions élémentaires en statistiques, donc un cours déjà complété en biométrie ou une introduction aux statistiques peut être exigé.

Étude des problèmes, hypothèses et théories en écologie végétale aux niveaux des populations et des communautés végétales. Les sujets traités seront choisis en fonction des intérêts de recherche des étudiantes et étudiants.

Recherches contemporaines en physiologie animale. Régulation adrénergique du métabolisme périphérique tel que l’activité du système nerveux autonome, la pression sanguine et le phénomène d’engraissement. Transport placentaire des diverses substances telles que le calcium, les phosphates et les acides gras et leurs conséquences sur la croissance fœtale. Régulation cellulaire du tissu adipeux par l’adénosine, les prostaglandines et les récepteurs adrénergiques. Sécrétion des hormones sexuelles et activité du métabolisme du tissu périphérique. Transport axonal, neurotransmetteurs et métabolisme musculaire. Métabolisme des lipides membranaires et sensibilité tissulaire. Certains sujets traités seront choisis en fonction des intérêts de recherche des étudiantes et étudiants.

Revue de la littérature récente en immunologie. Étude des mécanismes cellulaires et moléculaires des réponses immunitaires : naturelle, à médiation humorale et à médiation cellulaire. Examen des facteurs de l’environnement pouvant compromettre l’intégrité du système immunitaire et leurs conséquences biologiques. Ce cours comporte un volet sur les principes et la pratique des techniques immunologiques de pointe couramment utilisées en recherche.

Mécanismes cellulaires et moléculaires impliqués dans la régulation de la croissance et du développement des végétaux. Étude approfondie des données récentes sur les bases moléculaires de l’action de différents facteurs physiologiques et hormonaux qui régularisent l’activité métabolique et l’expression génétique des différents processus biologiques. Aspects moléculaires du phénomène d’adaptation à différents agents de stress chez les végétaux tels que le froid, la sécheresse, la chaleur et la salinité. Certains sujets traités seront choisis en fonction des intérêts de recherche des étudiantes et étudiants.

Historique et bases écologiques de la lutte biologique. Biologie des organismes prédateurs, parasites et pathogènes. Méthodologie : prospection, introduction et acclimatation. Conservation, augmentation et évaluation de l’efficacité des ennemis naturels. Lutte biologique contre les ravageurs des forêts et des cultures, contre les mauvaises herbes, contre les vecteurs d’importance médicale et vétérinaire et contre les mammifères. La lutte biologique en tant que composante de la lutte intégrée.

Cours à contenu variable portant sur l’écologie. Ce cours permettra aux étudiant(e)s de faire le point sur un aspect particulier du domaine visé.

Cours à contenu variable portant sur la physiologie cellulaire. Ce cours permettra aux étudiant(e)s de faire le point sur un aspect particulier du domaine visé.

Cours à contenu variable portant sur la toxicologie. Ce cours permettra aux étudiantes et étudiants de faire le point sur un aspect particulier du domaine visé.

Cours à contenu variable portant sur la biotechnologie. Ce cours permettra aux étudiantes et étudiants de faire le point sur un aspect particulier du domaine visé.

Présentation de concepts écologiques de pointe par des professeur(e)s en écologie; discussion d’articles pertinents aux thèmes choisis.

Étude des différentes méthodes utilisées en biotechnologie végétale pour l’amélioration des plantes. Fusion de protoplastes pour la formation d’hybrides somatiques, comparaison du croisement sexué avec l’hybridation somatique du point de vue de l’hérédité des gènes nucléaires et cytoplasmiques. Incompatibilité génétique chez les plantes supérieures, techniques de culture in vitro permettant de résoudre ce problème. Production et utilisation de plantes haploïdes, transfert direct d’organites. Transfert d’ADN par : coculture de tissus avec Agrobacterium, microinjection et électroporation. Expression des gènes transférés. Exemples d’applications : fixation de l’azote moléculaire, résistance aux virus, insectes et champignons. Cours intensif sous forme de travaux pratiques.

Étude et pratique des diverses techniques utilisées en biologie moléculaire. Purification d’ADN, clonage, sélection de transformants, préparation de plasmides, cartographie de sites de restriction. Analyse de gènes par transfert de Southern, sonde et hybridation moléculaires. Séquençage d’ADN par les méthodes enzymatique et chimique. Cours intensif sous forme de travaux pratiques.

Sujets touchant les divers aspects de l’expression génétique des virus animaux et végétaux en fonction des intérêts de recherche des étudiants participants. Les principaux thèmes abordés seront: le rôle des virus comme vecteurs génétiques; la dynamique du génome viral et de son expression phénotypique; la pathogénicité virale et sa modulation par des facteurs environnementaux.

Sujets de toxicologie s’adressant à des étudiantes et étudiants faisant des recherches dans différents domaines reliés à la toxicologie. Les principaux thèmes abordés seront : actions de toxiques (e.g. pesticides, métaux lourds) sur les organismes terrestres ou aquatiques; développements récents dans les méthodes et techniques analytiques utilisées en toxicologie.

Différents thèmes de biologie moléculaire appliqués à des systèmes vivants seront abordés : transcription, réplication, réparation et recombinaison de l’ADN. Structure des gènes. Régulation de l’expression génétique. Protéines transformantes et cancer. Manipulations génétiques. Biologie moléculaire du développement. Différenciation. Mutagénèse. Maladies et thérapies génétiques.

Introduction aux bonnes pratiques de fabrication, de même que la description des locaux, de l’équipement et du personnel requis ainsi que les mesures essentielles d’hygiène. Les implications des services de l’assurance qualité et du contrôle de la qualité dans la fabrication. Généralités et particularités applicables aux industries pharmaceutiques, biologiques, de produits diagnostiques, cosmétiques, alimentaires et sanitaires.

Discussion critique de sujets choisis en microbiologie environnementale, en microbiologie des streptomycètes et d’autres sujets de pointe se rapportant à la microbiologie industrielle. Les aspects de biologie moléculaire, de génie des protéines, de fermentation, de réglementation et des méthodes analytiques connexes seront étudiés. Apprentissage par problèmes.

Rappel des notions de base en génie génétique. Développement des techniques de clonage et de transfert de gènes chez certains microorganismes d’importance industrielle en rapport avec leur génétique respective. Les levures, les streptomycètes, les pseudomonades et le genre
bacillus seront examinés plus spécifiquement.

Les cellules des organismes vivants (bactéries, champignons, plantes, lichens, insectes et animaux supérieurs) sont des sites de synthèse complexe d’un grand nombre de composés organiques, dont plusieurs ont une activité biologique importante. L’étude de la biosynthèse de produits naturels fait appel à la chimie bioorganique, une discipline nouvelle née de la chimie, de la microbiologie et de la biochimie des produits naturels. Le cours donnera des notions de base sur les mécanismes de quelques réactions biologiques prédominantes.

Bref historique. Revue des paramètres des denrées alimentaires affectant la multiplication microbienne. Étude de la flore normale et des microbes pathogènes. Étude du phénomène de la putréfaction et les critères de qualité. Méthodes officielles ou suggérées d’analyse microbiennes. Normes microbiennes. Maladies alimentaires dues aux microbes, symptômes et voies de dissémination. Étude de différents traitements visant à améliorer la conservation des denrées alimentaires.

Introduction. « Design » de bioréacteurs. Milieux de culture utilisés pour les fermentations. Stérilisation des milieux de culture. Stérilisation de l’air. Aération et agitation. Fermentations en lots, par addition intermittente de substrat ainsi qu’en continu. Cinétique de la croissance. Récupération des produits de fermentation. Systèmes de contrôle des variables environnementales.

Applications de la microbiologie pour le traitement des sols et des effluents pollués. Ce cours traitera des techniques de bioremédiation sous l’angle plus spécifique de leurs aspects microbiologiques. Les aspects de biologie moléculaire, de fermentation, d’engineering, des normes environnementales et des techniques d’analyses seront développées. Études de cas. Leçons.